A fuvola tisztításának jobb módja, ha puha, száraz kendőt használunk a szennyeződések és a port eltávolításához. Ha nedvesség halmozódott fel a fuvola belsejében, használhat egy speciális tisztítórudat, amelyhez puha kendőt rögzítettek a hangszer belsejének szárításához. Az is jó ötlet, hogy a fuvolát időnként egy professzionális fuvolatechnikussal tisztítsa meg és karbantartja, hogy biztosítsa a fuvola jó játékállapotát.