Van azonban néhány bonyolultság:
* Elveszett művek: Számos munkája elveszett az időkben, megsemmisült vagy még mindig feltáratlan.
* Együttműködések: Van Eyck valószínűleg együttműködött a műhelyével, így néhány neki tulajdonított festményt asszisztensek készíthettek.
* Forrás: Egyes munkákat vitatják a művészettörténészek arról, hogy azokat kizárólag Van Eyck festette, vagy részben az ő műhelye.
Tehát bár van ésszerű elképzelésünk fennmaradt munkájáról, az általa készített festmények valódi száma rejtély marad.