* Természet és ökológia: Hundertwasser mélyen hitt az ember és a természet összekapcsolódásában. Művészete gyakran ábrázolt buja tájakat, fákat és állatokat, ünnepelve a természet szépségét és törékenységét.
* Architektúra: Az építészetet a művészet egy formájának tekintette, és hitt abban, hogy olyan épületeket hozzon létre, amelyek zökkenőmentesen keverednek a természetbe, íves vonalakkal, organikus formákkal és rengeteg zölddel. Festményein gyakran szerepeltek fantasztikus, biomorf épületek, kiemelve a fenntartható és harmonikus városi környezetről alkotott elképzelését.
* Spirálok és körök: Ezek a visszatérő motívumok az organikus növekedést, az életciklusokat és minden dolog összekapcsolódását szimbolizálják. Ezeket arra használta, hogy mozgás- és energiaérzetet keltsen alkotásaiban.
* Szín és textúra: Hundertwasser előszeretettel használt élénk, élénk színeket és kontrasztos textúrákat, hogy vizuálisan stimuláló és megnyerő kompozíciókat hozzon létre. Gyakran használt merész vonásokat és kavargó mintákat a mozgás és az élet érzésének közvetítésére.
* Anti-geometria és antiracionalitás: Elutasította a hagyományos, merev geometrikus formákat, és magáévá tette a szabálytalanság és a spontaneitás szépségét, tükrözve azt a meggyőződését, hogy a művészetnek személyes és intuitív kifejezésnek kell lennie.
E témákon kívül Hundertwasser a filozófia, a spiritualitás és a társadalmi kommentár elemeit is beépítette munkáiba, gyakran olyan témákkal foglalkozva, mint a környezetvédelem, a béke és a társadalmi igazságosság.