* A Légion d'honneur (Becsületlégió) , a legmagasabb francia érdemrendet 1878-ban és 1881-ben kapta.
* A Copley-érem (1874) , az egyik legrégebbi és legrangosabb tudományos díj a Londoni Királyi Társaságtól.
* Az Albert-érem (1882) , amelyet a Royal Society of Arts ítélt oda a tudomány és technológia terén végzett kiemelkedő hozzájárulása elismeréseként.
* Számos rangos akadémiára is beválasztották , beleértve a Francia Tudományos Akadémiát, a Londoni Királyi Társaságot és az Académie Française-t.
Ez csak néhány a számos díj és kitüntetés közül, amelyeket Louis Pasteur pályafutása során kapott. Széles körben minden idők egyik legjelentősebb tudósaként tartják számon, és munkássága mélyreható hatással volt az emberi egészségre és jólétre.