1. Az istenjátszás és a genetikai manipuláció veszélyei:
* A film rávilágít az élet tudományos eszközökkel, különösen a géntechnológiával történő manipulálásának etikai bonyolultságára. Az etikátlan kísérletezéssel létrehozott Mewtwo egzisztenciális válságban szenved, és bosszút áll az emberiség ellen, tükrözve az ellenőrizetlen tudományos ambíció lehetséges következményeit.
2. Az empátia és a megértés fontossága:
* Míg kezdetben a harag és a gyűlölet vezérelte, Mewtwo végül megtanulja az empátia és a kapcsolat értékét. Felismeri az általa okozott fájdalmat, és megérti a barátság valódi jelentését, bemutatva annak fontosságát, hogy a különbségek ellenére is megszólítson másokat.
3. A barátság és a szerelem ereje:
* A film hangsúlyozza Ash, Pikachu és társaik közötti erős baráti és szerelmi kötelékeket. Ezek a kapcsolatok végső soron segítenek legyőzni Mewtwo pusztító késztetéseit, és megértéshez és békéhez vezetnek.
4. Mások elfogadása, még akkor is, ha mások:
* A film a mások elfogadásának témáját dolgozza fel, még akkor is, ha másnak tűnnek, vagy más eredetűek. Ash és barátai együttérzést és megértést mutatnak Mewtwo iránt, végül lebontják a gátjait, és kapcsolatot alakítanak ki.
5. A megbocsátás szükségessége és a második esély:
* Mewtwo tetteit, bár pusztítóak voltak, fájdalma és magányossága táplálta. A film azt sugallja, hogy a megbocsátás és a második esély kulcsfontosságú a növekedés és a gyógyulás szempontjából, mind az egyének, mind a társadalom egésze számára.
Végső soron a „Pokémon:Az első film – Mewtwo Strikes Back” morálja többféleképpen értelmezhető, az egyes nézők nézőpontjától függően. A film azonban erőteljes üzenetet kínál az empátia, a megértés fontosságáról, valamint az ellenőrizetlen ambíció és a manipuláció lehetséges veszélyeiről.