Karrier elején:
* Breaking the Waves (1996): Kitörési szerepe, amivel Oscar-díjra jelölték a legjobb színésznő kategóriában.
* Hilary és Jackie (1998): A briliáns, de problémás hegedűművészt, Jacqueline du Prét alakította.
* A bokszoló (1997): Romantikus dráma, amely Észak-Írországban játszódik.
* Angela hamvai (1999): Az anyát játszotta Frank McCourt memoárjának ebben az adaptációjában.
Későbbi karrier:
* Vörös sárkány (2002): Thriller Thomas Harris regénye alapján.
* Peter Sellers élete és halála (2004): Peter Sellers feleségét játszotta.
* A világok háborúja (2005): Sci-fi film Tom Cruise főszereplésével.
* A lány a kávézóban (2005): Brüsszelben játszódó politikai dráma.
* A méhek titkos élete (2008): Dráma egy fiatal lányról, aki elmenekül, hogy megkeresse az anyját.
* A könyvtolvaj (2013): Történelmi dráma egy fiatal lányról a náci Németországban.
* Everest (2015): Helen Wilton szerepét játszotta.
* A világítótorony (2019): Pszichológiai horrorfilm Willem Dafoe-val.
* Louis Wain elektromos élete (2021): Emily Richardson szerepét játszotta.
* A király embere (2021): A Kingsman filmsorozat előzménye.
Egyéb figyelemre méltó filmek:
* The Escapist (2008): Krimi dráma.
* Anna Karenina (2012): Lev Tolsztoj regényének filmadaptációja.
* My Week with Marilyn (2011): Életrajzi dráma Marilyn Monroe-ról.
* Az elveszett lány (2021): Pszichológiai dráma Olivia Colman főszereplésével.
Ez csak egy minta Emily Watson lenyűgöző filmográfiájából. Továbbra is aktív és elismert színésznő, és még sok más projektje van.