Ebben a sorozatban a főszereplő, Mikey Kudo és barátai a digitális világba kerülnek, és a Digimon partnereihez kötődnek. Azonban ahelyett, hogy közvetlenül átalakulnának, „összeolvadnak” a Digimonjukkal, ami egy ember-Digimon hibrid formát eredményez, „Fusion Fighters” néven. Ez lehetővé teszi számukra, hogy kihasználják a Digimon képességeit és harcoljanak velük.
A sorozat a barátság, a csapatmunka és a kihívások leküzdésének témáit járja körül, miközben eligazodnak a digitális világ veszélyeiben.