A regény Bruno, egy kilencéves német fiú szemszögéből íródott, aki nincs tisztában apja munkájának valódi természetével és az otthonukkal szomszédos koncentrációs táborban elkövetett atrocitásokkal. Bruno szemén keresztül az olvasók szemtanúi az éles ellentétnek az általa élt kiváltságos élet és a kemény valóság között, amellyel Shmuel és más tábori foglyok szembesülnek.
Boyne karakterábrázolása hangsúlyozza a háború és az előítéletek pusztító hatásait az egyénekre és a társadalomra egyaránt. Bruno naiv gyerekből olyan valakivé válása, aki elkezdi megkérdőjelezni a körülötte lévő világot, rávilágít az oktatás és az empátia fontosságára a gyűlölet és az intolerancia elleni küzdelemben. Bruno és Shmuel barátsága a körülményeik által támasztott akadályok ellenére az emberi lélek ellenálló képességének erőteljes szimbóluma még az elképzelhetetlen szenvedéssel szemben is.
Ezen túlmenően Boyne egyszerű nyelvezetének és közvetlen történetmesélésének köszönhetően az események súlya mélyen visszahat az olvasókra, fiatalokra és idősekre egyaránt. Azáltal, hogy a holokauszt borzalmait gyermeki szemszögből mutatja be, átadja ezeknek az eseményeknek a mélyreható hatását anélkül, hogy grafikus leírásokhoz folyamodna. Ez a megközelítés aláhúzza azt az egyetemes üzenetet, hogy a háború és az intolerancia pusztító erők, amelyekkel szembe kell szállni és fel kell számolni.
Összességében a "Csíkos pizsamás fiú" megrendítő emlékeztetőül szolgál az ellenőrizetlen előítéletek és gyűlölet következményeire, és erőteljesen támogatja a békét, a toleranciát és a megértést a különböző hátterű emberek között.