A regény során Jim és barátai, köztük Dr. Livesey és Squire Trelawney veszedelmes utazásra indul, hogy Silver legénysége előtt megtalálják a kincset. A konfliktus fokozódik, ahogy különféle akadályokkal kell szembenézniük, beleértve a viharokat, az áruló terepeket és a kalózokkal való összecsapásokat. A végső összecsapás akkor következik be, amikor a kalózok fellázadnak, és megpróbálják átvenni az irányítást a hajó felett, ami csúcsos csatához vezet Jim és szövetségesei között Silver és emberei ellen.
A "Kincses-sziget"-i konfliktus lényegében a gazdagságra és a kapzsiságra való törekvés, valamint a hatalomért és az irányításért folytatott küzdelem vezérli. A szereplők motivációi és vágyai szembeállítják őket egymással, ami feszültséget és feszültséget kelt, ahogy a történet kibontakozik. Ezenkívül a konfliktus rávilágít a jó és a rossz témájára, mivel Jim és barátai az őszinteséget és a hűséget képviselik, míg Silver és legénysége a csalást és az árulást testesíti meg.