A legfontosabb hozzájárulások:
* Az elektron felfedezése: 1897-ben Thomson kísérleteket végzett katódsugárcsövek használatával, amelyek kimutatták, hogy a katódsugarak negatív töltésű részecskékből állnak, amelyeket "testek"-nek nevezett el. Ezeket a részecskéket később elektronnak ismerték fel.
* Az atom szilvapuding modellje: Thomson javasolta az atom "szilvapuding modelljét", amely azt sugallta, hogy az atom egy pozitív töltésű gömb, amelybe negatív töltésű elektronok vannak beágyazva, mint a szilva a pudingban.
* Pozitív sugarak: Thomson a "pozitív sugarakat" is vizsgálta (később pozitív töltésű ionokként azonosították), amelyeket 1898-ban fedezett fel. Meghatározta töltés/tömeg arányukat, és kimutatta, hogy elektromos és mágneses mezők eltéríthetik őket.
* Izotópok: A pozitív sugarak tanulmányozása során Thomson rájött, hogy a különböző elemeknek azonos kémiai tulajdonságú, de eltérő tömegű atomjai lehetnek. Ezeket a különböző formákat "izotópoknak" nevezte, amelyekről ma már tudjuk, hogy ugyanazon elem atomjai, különböző számú neutronnal.
Díjak és kitüntetések:
* Fizikai Nobel-díj (1906)
* Knight Bachelor (1908)
* Érdemrend (1908)
* Cavendish fizikaprofesszor a Cambridge-i Egyetemen (1884-1918)
Hagyományos:
Thomson munkája forradalmasította az atomról és az anyag természetéről alkotott ismereteinket. Az elektron felfedezése megteremtette a modern atomfizika és kvantummechanika alapjait. A 20. század egyik legbefolyásosabb fizikusaként tartják számon.