1677-ben halt meg a tengeren. Halálának konkrét okát azonban nem jegyezték fel.
Fontos megjegyezni, hogy egy bálnavadász élete a 17. században veszélyes és kemény volt. A halál gyakori okai a következők lehetnek:
* Tengeri balesetek: A viharok, a hajótörések, az árbocról való lezuhanás és a bálnákkal való találkozás kockázatot jelentett.
* Betegség: A skorbut, a vérhas és más betegségek gyakoriak voltak a hosszú utakon.
* Erőszak: A kalózok és a rivális bálnavadász-csapatok fenyegetést jelenthetnek.
Konkrétabb történelmi feljegyzések nélkül csak találgathatunk Francis Folger halálának pontos okáról.