Holtan találták az irodájában a New York-i Greenwich Village-ben. Halálát gyilkosságnak minősítették , a kézi fojtogatás és a fej tompa erejű traumája következtében .
Az esetet kezdetben lehetséges öngyilkosságként kezelték, de egy későbbi vizsgálat során kiderült, hogy Shellyt egy építőmunkás gyilkolta meg Diego Pillco néven .
Pillco, aki korábban azon az épületen dolgozott, ahol Shelly irodája volt, bevallotta a bűncselekményt és emberölésért ítélték el .
Shelly halála tragikus veszteség volt a filmipar számára, és öröksége továbbra is inspirálja a törekvő filmeseket.