* A látszat alapján történő ítélkezés veszélyei: A történet rávilágít arra, hogy a kezdeti benyomások milyen könnyen félrevezethetnek bennünket. Az olvasó a rendőrséghez hasonlóan eleinte az ártatlan Charles McCarthyt gyanúsítja durva külseje és az alapján, hogy az apjával veszekedett.
* Az igazság és az igazságosság keresésének fontossága: A történet hangsúlyozza, hogy túl kell tekinteni a felületes ítéleteken, és bele kell mélyedni az igazságba, bármilyen kényelmetlen vagy kényelmetlen is az. Holmes módszeres nyomozása feltárja a valódi tettest, megmutatva, hogy feltételezéseken keresztül nem lehet igazságot elérni.
* A kapzsiság és az önzés következményei: A történet bemutatja, hogy az ellenőrizetlen kapzsiság és önzés milyen pusztító következményekkel járhat. Az öröklési vágy által vezérelt gyilkosság a kapzsiság pusztító erejét hangsúlyozza.
* Az emberi kapcsolatok törékenysége: A történet az apák és fiúk közötti bonyolult és gyakran feszült kapcsolatokat tárja fel. A Károly és apja közötti, tragédiába torkolló feszültség a családi kötelékek sebezhetőségét mutatja.
* A kritikai gondolkodás és megfigyelés fontossága: Holmes sikere a rejtély megfejtésében abban rejlik, hogy képes volt aprólékosan megfigyelni a részleteket és elemezni a bizonyítékokat. Arra ösztönzi az olvasót, hogy kritikusan gondolkodjon, és ne fogadja el névértéken a látszatot.
Végső soron a Boscombe Valley-rejtély emlékeztet arra, hogy a látszat megtévesztő, és hogy az igazi igazságszolgáltatás alapos vizsgálatot és hajlandóságot kíván megkérdőjelezni a feltételezéseket. Hangsúlyozza az igazság és az igazságosság keresésének fontosságát, még akkor is, ha az kényelmetlen, és annak következményeit, ha hagyjuk, hogy a kapzsiság és az önzés elhomályosítsa ítéletünket.