Enhancerek:Ezek olyan DNS-szekvenciák, amelyek megkötik a transzkripciós faktorokat és elősegítik a közeli gének transzkripcióját. Például az immunglobulin nehézlánc-lókuszában található fokozó felelős e gének magas szintű expressziójáért a B-sejtekben.
Promoterek:Ezek olyan DNS-szekvenciák, amelyek megkötik az RNS-polimerázt és elindítják a gének transzkripcióját. Például a humán növekedési hormon gén promótere felelős ennek a génnek az agyalapi mirigyben történő expressziójáért.
Hangtompítók:Ezek olyan DNS-szekvenciák, amelyek megkötik a transzkripciós faktorokat és elnyomják a közeli gének transzkripcióját. Például a humán β-globin gén hangtompítója felelős e gén elnyomásáért a nem eritroid sejtekben.
Transzakcionális szekvenciák:
Transzkripciós faktorok:Ezek olyan fehérjék, amelyek cisz-hatású szekvenciákhoz kötődnek, és szabályozzák a gének transzkripcióját. Például az Oct-1 transzkripciós faktor az immunglobulin nehézlánc-fokozó oktamer motívumához kötődik, és elősegíti e gének B-sejtekben történő transzkripcióját.
RNS-polimeráz:Ez egy fehérjekomplex, amely a promóterekhez kötődik, és a géneket RNS-vé írja át.
Egyéb szabályozó fehérjék:Ezek olyan fehérjék, amelyek cisz-hatású szekvenciákhoz kötődnek, és különféle módokon szabályozzák a gének transzkripcióját. Például a CTCF fehérje kötődik a CCCTC motívumhoz a humán β-globin génben, és segít megszervezni ennek a régiónak a kromatin szerkezetét, ami szükséges a gén repressziójához nem eritroid sejtekben.