1. Dementor támadás: A könyv azzal kezdődik, hogy Harryt dementorok támadják meg, miközben mugli unokatestvére, Dudley háza felé tart. Egy Patrónus bűbájt használ, hogy leküzdje a dementorokat, de illegális varázslatának Roxforton kívüli használata miatt kiutasítják.
2. A Főnix Rendje: Sirius Black, Harry keresztapja közli vele, hogy a Mágiaügyi Minisztérium megpróbálja elnyomni a Voldemort visszatéréséről szóló híreket. Ennek leküzdésére Dumbledore megalakítja a Főnix Rendjét, egy titkos szervezetet, amely a Voldemort és követői elleni harcra hivatott.
3. A minisztériumi propaganda: A minisztérium hiteltelenné teszi Harry beszámolóját Voldemort visszatéréséről, és hazugnak és figyelemfelkeltőnek bélyegzi meg. A Daily Prophet, egy varázsló újság negatív cikkeket közöl Harryről, tovább rontva a hírnevét.
4. Védelem a sötét varázslatok ellen: Dolores Umbridge-et, a minisztérium egyik magas rangú tisztviselőjét nevezik ki a Sötét Varázslatok elleni védelem új professzorává a Roxfortban. Nem hajlandó gyakorlati védekező varázslatokat tanítani a hallgatóknak, arra hivatkozva, hogy az elméleti tudás elegendő.
5. Diáklázadás: Umbridge módszerei és a minisztérium nem hajlandó elfogadni a Voldemortról szóló igazságot csalódottan, Harry, Hermione Granger és Ron Weasley megalapítják a Dumbledore's Army nevű földalatti diákszervezetet. Titokban találkoznak, hogy megtanulják a megfelelő védekezést a sötét varázslatok ellen.
6. Egy prófécia kiderült: Harry megtudja a Rejtélyek Osztályában elrejtett jóslatból, hogy neki vagy Voldemortnak meg kell ölnie a másikat a túléléshez. Sorsuk elválaszthatatlanul összefügg.
7. Csata a rejtélyek osztályán: Voldemort a Rejtélyek Osztályára csábítja Harryt és barátait, hogy megkeresse a jóslatot, amely szerinte garantálni fogja halhatatlanságát. Feszült csata kezdődik Dumbledore hadserege és a halálfalók, Voldemort követői között. Sirius Black meghalt a konfliktus során, tönkretéve Harryt.
8. A feltárt igazság: Harryt felmentik, miután a Mágiaügyi Minisztérium tanúja volt Voldemort visszatérésének. Dumbledore megerősíti, hogy Voldemort kisbabaként megpróbálta megszállni Harryt, de nem sikerült.
9. Aftermath és cliffhanger: A könyv azzal ér véget, hogy a varázslóvilág készenlétben áll, tudván, hogy elkerülhetetlen egy jelentős csata Voldemort és csapatai ellen.
A "Harry Potter és a Főnix Rendje" a barátság, a bátorság és az igazáért való küzdelem fontosságát kutatja a sorozat menetét megváltoztató csúcscsata közepette.