1. vége:A legendás duó (partner:Pikachu)
* Partner: Pikachu
* Végső csataválasztás: Fogadd el az ajánlatot, és légy az új Legendary Duo
Ez a befejezés megmutatja, hogy te és Pikachu leszel az új Legendás Duó, amelynek feladata, hogy megvédje a világot a sötétségtől. Happy end, de egyben súlyos felelősséget és folyamatos elkötelezettséget is jelent a mentőcsapat élete iránt.
2. vége:A mentőcsapat útja folytatódik (partner:bármely más Pokémon)
* Partner: Bármilyen Pokémon, kivéve Pikachut
* Végső csataválasztás: Vesd vissza az ajánlatot, hogy az új Legendary Duo legyen
Ez a befejezés a Mentőcsapat folyamatos kalandjára összpontosít, hangsúlyozva a csapat erős kötelékét és a mások segítése iránti elkötelezettségüket. Azt mutatja meg, hogy te és a partnered továbbra is segítesz a rászoruló Pokémonoknak, és együtt fedezik fel a világot.
Fontos megjegyzés:
* Fontos megjegyezni, hogy a Legendás Duóvá válás csak akkor lehetséges, ha Pikachuval játszik partnerként.
* Bár minden partner egyedi párbeszéddel és személyiséggel rendelkezik, a történet általános íve és a játékon belüli választási lehetőségek ugyanazok maradnak, függetlenül attól, hogy melyik partnert választottad.
Nem számít, melyik végkifejletet kapod, mindkét befejezés bemutatja a Pokemon Mystery Dungeon Mentőcsapat teljes és tartalmas utazását, kiemelve a barátság, a csapatmunka és az önfeláldozás témáit.