* Személyes harag: Putnamnak voltak nézeteltérései sok olyan emberrel, akiket boszorkánysággal vádolt. Például vitába keveredett George Jacobsszal egy földterület miatt, és sikertelenül beperelte Martha Coreyt rágalmazásért.
* Vallási meggyőződés: Putnam jámbor puritán volt, és úgy vélte, hogy a boszorkányság valódi veszélyt jelent a közösségre. Úgy vélte, hogy a boszorkányok szövetségben állnak az ördöggel, és képesek kárt okozni másoknak.
* Pénzügyi haszon: Putnamot anyagi haszon is motiválhatta. Összeszedhette a boszorkányságért elítéltek vagyonát, és kártérítést is kaphatott a boszorkányperek kivizsgálásával töltött idejéért.
Fontos megjegyezni, hogy nem mindenki volt bűnös azok közül, akiket Thomas Putnam boszorkánysággal vádolt. Valójában sokan közülük ártatlan emberek voltak, akiket egyszerűen azért vettek célba, mert személyes sérelmük volt Putnammal, vagy mert egy marginalizált csoport tagjai voltak.