* Rex Goodwin: A Sötét aláírók vezetője és a sorozat fő antagonistája.
* Devack: Az első Dark Signer, aki megjelent, és Yusei Fudo egykori barátja.
* Roman Goodwin: Rex testvére, és a második Sötét Aláíró, aki megjelenik.
* Kalinin: Egy orosz sötét aláíró, aki sötét kártyát használ mások manipulálására.
* ködös: Egy titokzatos nő, aki az ötödik sötét aláíróként jelenik meg.
* Z-one: Egy erős lény a jövőből, aki a sorozat eseményeit hangszereli. Gyakorlatilag nem Sötét Signer, de erős kapcsolata van velük.
* Antinómia: Rejtélyes figura, aki a Z-one mellett jelenik meg, és a Sötét Aláírókhoz is kapcsolódik.
Fontos megjegyezni, hogy míg a Sötét aláírók az elsődleges antagonisták, a Z-one és az Antinomy összetettebb karakterek, saját motivációkkal.