A legelterjedtebb intonációhangolást Pythagorean hangolásnak nevezik. A pitagoraszi hangolásban az oktáv (két, egymáshoz képest kétszer magasabban vagy mélyebben megszólaló hang közötti intervallum) 12 egyenlő lépésre van felosztva. Ezen lépések mindegyikét félhangnak nevezzük.
A következő táblázat a kromatikus skála hangjai közötti intervallumokat mutatja Pitagorasz hangolásban, frekvenciaarányban kifejezve:
* C:1/1
* C♯:256/243
* D:9/8
* D♯:32/27
* E:5/4
* F:4/3
* F♯:45/32
* G:3/2
* G♯:512/343
* V:5/3
* A♯:6/5
* B:15/8
Amint a táblázatból látható, a pitagoraszi hangolás egyes hangjai közötti intervallumok nem teljesen egyenlőek. Például a C és C♯ közötti intervallum (ezt félhangnak hívják) kisebb, mint a D és D♯ közötti intervallum (más néven félhang). Ennek az az oka, hogy a Pitagorasz hangolásában az intervallumok a kis egész számok arányain alapulnak, nem pedig egyenlő intervallumokon.
Az igazságos intonáció egyenlőtlen hangközei összetettebb és érdekesebb hangzást hozhatnak létre, mint az azonos temperamentumú hangolás egyenlő hangközei. Azonban az intonációt is nehezebb lehet hangolni, mivel a zenészeknek kissé módosítaniuk kell hangjaik hangmagasságát az intervallumokhoz.