- Szimfóniák :Haydn több mint 100 szimfóniát komponált, és ezek közül sok a klasszikus korszak remekműve. Leghíresebb szimfóniái közül néhány:
- 45. szimfónia, "Búcsú"
- 60. szimfónia, "Il distratto"
- 88. szimfónia, "V. levél"
- 92. szimfónia, "Oxford"
- 94. szimfónia, "Meglepetés"
- 101. szimfónia, "Óra"
- 103. szimfónia, "Dobper"
- 104. szimfónia, "London"
- Vonósnégyesek :Haydn több mint 80 vonósnégyest is komponált, amelyeket a műfaj egyik legszebb példájának tartanak. Leghíresebb vonósnégyesei közül néhány:
- G-dúr vonósnégyes op. 76, 1. sz
- C-dúr vonósnégyes op. 76, No. 3 ("Császár")
- F-moll vonósnégyes op. 20, 5. sz
- g-moll vonósnégyes op. 74, No. 3 ("The Rider")
- D-moll vonósnégyes op. 76, No. 2 ("Quinten")
- B-dúr vonósnégyes op. 76, No. 4 ("Sunrise")
- zongoraszonáták :Haydn több mint 50 zongoraszonátát komponált, melyeket eleganciájuk és szellemességük jellemez. Leghíresebb zongoraszonátái közé tartozik:
- C-dúr zongoraszonáta, Hob. XVI:50
- D-dúr zongoraszonáta, Hob. XVI:24
- Esz-dúr zongoraszonáta, Hob. XVI:49
- F-dúr zongoraszonáta, Hob. XVI:23
- G-dúr zongoraszonáta, Hob. XVI:40
- Koncertek :Haydn különféle hangversenyeket komponált különböző hangszerekre, köztük hegedűversenyeket, csellóversenyeket és zongoraversenyeket. Leghíresebb versenyművei közé tartozik:
- G-dúr hegedűverseny, Hob. VIIa:4
- C-dúr csellóverseny, Hob. VIIb:1
- D-dúr zongoraverseny, Hob. XVIII:11
- B-dúr zongoraverseny, Hob. XVIII:13
- Oratóriumok :Haydn több oratóriumot is komponált, amelyek nagyszabású, vallásos szövegű kórusművek. Leghíresebb oratóriumai közé tartozik:
- A teremtés
- Az évszakok
- Il ritorno di Tobia