Holbein munkásságában az egyik legszembetűnőbb a szimbolizmus és az allegória használata. Gyakran használt tárgyakat és figurákat absztrakt fogalmak vagy ötletek megjelenítésére, festményei pedig tele vannak rejtett jelentésekkel és hivatkozásokkal. Például "A nagykövetek" (1533) című festményén számos olyan szimbólum szerepel, amelyek az akkori politikai és vallási feszültségekre utalnak. Az előtérben látható koponya például az élet mulandóságára emlékeztet, a lant és a zenés könyvek pedig a világegyetem harmóniáját képviselik.
Holbein a szatíra mestere is volt, és művei gyakran tele vannak humoros és kritikus társadalommegfigyeléssel. "A haláltánc" (1526-27) című festményén például a Halált ábrázolja, amint az élet minden területéről érkező emberek körmenetét vezetik, a királyoktól és pápáktól a parasztokig és koldusokig. A festmény arra emlékeztet, hogy a halál elkerülhetetlen, és senki sem mentesül tőle, társadalmi helyzetétől vagy vagyonától függetlenül.
Holbein munkái értékes bepillantást nyújtanak az északi reneszánsz világába. Festményei a kor társadalmi, politikai és vallási változásait tükrözik, és egyedi perspektívát kínálnak az akkori emberekre és eseményekre.