2. Keressen meg egy titkos bázishelyet. Sok különböző titkos bázishely található Sinnoh-ban. A legnépszerűbb helyek közé tartozik:
* A kis sziget a 218-as úton
* A barlang az Elveszett torony bejárata közelében, a 213-as úton
* Az építés alatt álló ház Pastoria Cityben
3. Használja a Secret Base Kit-et. Miután megtalálta a titkos bázishelyet, használja a Secret Base Kit-et a bázis létrehozásához. Kiválaszthatod, hogy milyen típusú alapot szeretnél létrehozni, illetve bútorokkal és egyéb tárgyakkal is díszítheted.
4. Toborozzon csapattagokat. Más játékosokat is toborozhatsz, hogy csatlakozzanak titkos alapcsapatodhoz. Ehhez beszéljen a felvenni kívánt személlyel, és válassza a „Toborzás” lehetőséget.
5. Csak más csapatokkal. Megküzdhetsz más csapatok titkos bázisaival, ha beszélsz a bázis bejáratánál lévő személlyel, és kiválasztod a „Csatta” opciót. A titkos alapcsaták 2-2 csaták, és az a csapat nyer, amelyik elsőként kiejti mindkét ellenfele Pokemonját.
6. Szerezzen pontokat és jutalmakat. Titkos alapcsaták megnyerésével és titkos bázisküldetések teljesítésével pontokat szerezhet. A pontok segítségével vásárolhat tárgyakat a Secret Base Shopból, és felhasználhatja azokat a titkos bázis frissítésére is.