Séguy a franciaországi Toulonban született 1877. július 1-jén. Fiatalon rajongott a természetrajzért, és 12 évesen kezdett rovarokat gyűjteni. A Montpellier Egyetemen orvost tanult, majd 1902-ben szerzett diplomát.
Séguy katonaorvosként kezdte pályafutását, de hamarosan a rovartannak szentelte magát. 1906-tól 1942-es nyugdíjazásáig a párizsi Muséum National d'histoire naturelle-ben dolgozott. A múzeumban eltöltött ideje alatt a kétszárnyúak gyűjteményét gondozta, és számos tudományos cikket és könyvet publikált a témában.
Séguy fő kutatási területe a Muscidae család volt, és e csoport világszakértőjévé vált. Több mint 1000 új Muscidae fajt írt le, és számos monográfiát és katalógust publikált a családról. A kétszárnyúak más családjain is dolgozott, beleértve a Tephritidae, Conopidae és Cecidomyiidae családokat.
Tudományos munkája mellett Séguy több tudományos társaságnak is aktív tagja volt, köztük a Société Entomologique de France-nak és a Londoni Királyi Rovartani Társaságnak. 1939-ben megkapta a londoni Linnean Society Linnean-érmét, 1949-ben pedig a párizsi Académie des Sciences Prix Constant díját.
Séguy 1951. október 23-án hunyt el Párizsban, 74 éves korában. Termékeny rovarkutató volt, aki jelentős mértékben hozzájárult a kétszárnyúak kutatásához, és munkásságát a mai napig széles körben idézik a tudósok.