1. A konfliktus a külvilággal: Santiago különféle külső akadályokkal néz szembe utazása során. Ezek a következők:
* A sivatag veszélyei: Tolvajokkal, zord időjárással, valamint a kiszáradás és az éhezés állandó fenyegetésével találkozik.
* A kulturális különbségek és előítéletek: Gyanakvással és bizalmatlansággal néz szembe a különböző kultúrájú és hátterű emberek részéről, különösen a sivatagban.
* A saját félelmei és bizonytalanságai leküzdésének kihívása: Ide tartozik a félelme, hogy mindent elveszít, kétségei a saját képességeivel kapcsolatban, és a társadalmi elvárások nyomása.
2. A konfliktus belső énjével: Santiago jelentős belső küzdelmet él át útja során, és a következőkkel küzd:
* Kétségei és félelmei: Megkérdőjelezi saját képességeit és álma érvényességét, gyakran enged a félelemnek és a halogatásnak.
* A kényelem és a biztonság kísértése: Kísértést érez, hogy felhagyjon utazásával és visszatérjen megszokott életéhez, feláldozva álmát a kényelmes életért.
* Hitének megőrzéséért folytatott küzdelem: Santiagónak folyamatosan emlékeztetnie kell magát a Személyes Legendába vetett hitére, és le kell győznie a szkepticizmust és a negativitást, amely saját belső hangjából és az őt körülvevő világból fakad.
Ezek a külső és belső konfliktusok összefonódnak, és hozzájárulnak a könyv átfogó témájához, amely az álmok követésének és az önfelfedező utazásnak a fontossága.