Szájhagyományok: Sok korai kultúrában a zene szóban öröklődött nemzedékről nemzedékre. Ez azt jelenti, hogy a zene folyamatosan változott és fejlődött, és nincs végleges feljegyzés arról, hogy milyen volt az adott időpontban.
Időbeli változások: A korai kultúrák zenéje az idők során jelentősen megváltozott. Ennek oka számos tényező, például a nyelv, a kultúra és a hangszerek változása. Emiatt nehéz pontosan megmondani, hogyan hangzott a korai kultúrák zenéje.
Korlátozott számú régészeti bizonyíték: A régészeti leletek betekintést nyújthatnak a korai kultúrák zenéjébe. A régészek például több ezer éves hangszereket, például fuvolákat és dobokat találtak. Ez a bizonyíték azonban gyakran töredékes és hiányos, és nehéz lehet értelmezni, hogyan használták ezeket a hangszereket zenéléshez.
Változatos zenei hagyományok: A korai kultúrákban sokféle zenei hagyomány létezett, és mindegyik hagyománynak megvoltak a maga egyedi jellemzői. Ez megnehezíti az általánosítást a korai kultúrák zenéjével kapcsolatban, hiszen nem volt egységes, egységes zenei hagyomány.
E kihívások ellenére a tudósok sokat tanulhattak a korai kultúrák zenéjéről. A szájhagyományok, a régészeti bizonyítékok és más források tanulmányozása révén a tudósok betekintést nyerhettek abba, hogy a zene milyen szerepet játszott a korai társadalmakban, és hogyan használták fel.