A Fülöp-szigeteki Davao városában, Davao városában született, és feleségül vette Mercedes Cachot. Ő volt Davao város egykori polgármestere, Sara Duterte, az alelnök lánya, Inday Sara Duterte-Carpio és a Davao 3. kerületi kongresszusi képviselő, Paolo "Pulong" Duterte.
A davaoi politika veteránja, Alvarez először 1965-ben lépett be a politikába, amikor a város alelnökévé választották. Két cikluson át tartó polgármesteri tisztségét a környék muszlim lázadói elleni kampány és agresszív gazdaságfejlesztési program jellemezte. Ferdinand Marcos elnöki posztját is támogatta.
A hadiállapot idején Alvarezt 1978-ban Davao 3. kerületének képviselőjévé választották. 1980-ban és 1984-ben újraválasztották. Marcos gépezetének szerves része volt, és a néhai elnök szövetségese.
Amikor 1986-ban Marcost megbuktatták a People Power Revolution során, Alvarez oldalt váltott, és csatlakozott Corazon Aquino elnök kormányához. Ezt követően honvédelmi miniszternek nevezték ki.
1987-ben a Fülöp-szigeteki Kókusz Hatóság adminisztrátorává nevezték ki. 1990-ig szolgált.