A butikot a Beatles barátja és művészeti munkatársa, Simon Posthuma tervezte, aki az albumborítókat és egyéb promóciós anyagokat is megtervezte. A Beatleshez és más, az Apple Recordshoz köthető előadókhoz kapcsolódó árucikkek kiskereskedelmi üzletének szánták, beleértve a ruházati cikkeket, kiegészítőket és háztartási cikkeket.
Az üzlet színes és pszichedelikus dekorációjáról volt ismert, amely az 1960-as évek végének esztétikáját tükrözte. A Beatles által tervezett tárgyak is szerepeltek benne, például pólók, sálak és ékszerek.
Az Apple Boutique azonban kezdettől fogva kihívásokkal kellett szembenéznie, beleértve a vezetői tapasztalat hiányát, a rossz pénzügyi gazdálkodást és a többi üzlet által támasztott versenyt. A Beatlesnek nehézségekbe ütközött az ingatlan bérleti szerződése is, valamint nézeteltérések támadtak közöttük és tanácsadóik között az üzlet irányával kapcsolatban.
Ennek eredményeként az Apple Boutique 1968 augusztusában, mindössze egy év működés után bezárt. A Beatles jelentős pénzügyi veszteségeket szenvedett el a vállalkozás miatt, és az üzlet bezárása a kiskereskedelmi üzletágban való közvetlen részvételük végét jelentette.