A történet előrehaladtával azonban feszültségek támadnak, amikor egy kiválasztott sertéscsoport manipulálni és kizsákmányolni kezdi állattársait. A konfliktus fokozódik, amikor a disznók a ravasz és tekintélyelvű vaddisznó Napóleon vezetésével a hétparancsolat – a gazdaság vezérelvei – módosításába kezdenek, hogy saját érdekeiket szolgálják.
Napóleon és sertéstársai fokozatosan vezető szerepet töltenek be, és olyan hierarchikus rendszert hoznak létre, amely a többi állat fölé helyezi őket. Ez mély megosztottsághoz vezet az állatközösségen belül, mivel Napóleon és csatlósai kiváltságokat és luxust élveznek, míg a többi állat a farm fenntartásán fáradozik.
A konfliktus a disznók hatalomra való törekvése és a többi állat azon küzdelme körül forog, hogy fenntartsák kezdeti lázadásuk eszméit. Végső soron az Animal Farm által a valódi egyenlőség előmozdításával kapcsolatos kihívások feltárása a totalitárius társadalmak és a látszólag nemes ideológiák korrupciójának kritikájává válik.